AT4G24520.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.969 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : P450 reductase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cyp450 reductase likely to be involved in phenylpropanoid metabolism. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
P450 reductase 1 (ATR1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding (InterPro:IPR001433), Ferredoxin reductase-type FAD-binding domain (InterPro:IPR017927), Riboflavin synthase-like beta-barrel (InterPro:IPR017938), FAD-binding, type 1 (InterPro:IPR003097), Flavodoxin/nitric oxide synthase (InterPro:IPR008254), Flavoprotein pyridine nucleotide cytochrome reductase (InterPro:IPR001709), NADPH Cytochrome P450 Reductase (InterPro:IPR015702); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: P450 reductase 2 (TAIR:AT4G30210.2). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:12663065..12667066 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 76329.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 688 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTSALYASDL FKQLKSIMGT DSLSDDVVLV IATTSLALVA GFVVLLWKKT TADRSGELKP LMIPKSLMAK DEDDDLDLGS GKTRVSIFFG TQTGTAEGFA 101: KALSEEIKAR YEKAAVKDDY AADDDQYEEK LKKETLAFFC VATYGDGEPT DNAARFYKWF TEENERDIKL QQLAYGVFAL GNRQYEHFNK IGIVLDEELC 201: KKGAKRLIEV GLGDDDQSIE DDFNAWKESL WSELDKLLKD EDDKSVATPY TAVIPEYRVV THDPRFTTQK SMESNVANGN TTIDIHHPCR VDVAVQKELH 301: THESDRSCIH LEFDISRTGI TYETGDHVGV YAENHVEIVE EAGKLLGHSL DLVFSIHADK EDGSPLESAV PPPFPGPCTL GTGLARYADL LNPPRKSALV 401: ALAAYATEPS EAEKLKHLTS PDGKDEYSQW IVASQRSLLE VMAAFPSAKP PLGVFFAAIA PRLQPRYYSI SSSPRLAPSR VHVTSALVYG PTPTGRIHKG 501: VCSTWMKNAV PAEKSHECSG APIFIRASNF KLPSNPSTPI VMVGPGTGLA PFRGFLQERM ALKEDGEELG SSLLFFGCRN RQMDFIYEDE LNNFVDQGVI 601: SELIMAFSRE GAQKEYVQHK MMEKAAQVWD LIKEEGYLYV CGDAKGMARD VHRTLHTIVQ EQEGVSSSEA EAIVKKLQTE GRYLRDVW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)