AT4G23895.3
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.560 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Pleckstrin homology (PH) domain-containing protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Pleckstrin homology (PH) domain-containing protein; FUNCTIONS IN: nucleoside diphosphate kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: UTP biosynthetic process, GTP biosynthetic process, CTP biosynthetic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pleckstrin homology-type (InterPro:IPR011993), Nucleoside diphosphate kinase, core (InterPro:IPR001564), Pleckstrin homology (InterPro:IPR001849); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Nucleoside diphosphate kinase family protein (TAIR:AT4G23900.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:12422883..12426318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52002.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 467 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDDGTPKKLN ILPDHFSAPS PTAESSQHDT PSSSQPKDDS SLRPYSQSRT RRNLKRAATM LNLFTLRRLP WVSDGQEKVE LSAAELESLR SELSDMEERE 101: AYLKAQLEHV DEVLRSARLS GYLFIRSRWA ALPGEPPPID DTEVDDWLPR FVVLQGPCLF FYLLSTDLSP QDSTLLADIV EIGSVPSYTR EFDETHYCFY 201: ILTRQGLRFE CSSTSKTQVD SWLSVLRLDC KSEPEERSAS RAARSLLSSA KNARFFSEGR AIGAASVVHA TGKVPQYASN FGKSGSGFVS NSWITGLLAL 301: PAAAFMLQDQ EALAAEMERT FIAIKPDGVQ RGLISEIITR FERKGYKLVG IKVMVPSKGF AQKHYHDLKE RPFFNGLCNF LSSGPVVAMV WEGEGVIRYG 401: RKLIGATDPQ KSEPGTIRGD LAVVVGRNII HGSDGPETAK DEISLWFKPE ELVSYTSNAE KWIYGQN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)