AT4G23310.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cysteine-rich receptor-like protein kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 23 (CRK23); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: defense response; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: stem, leaf whorl, leaf; EXPRESSED DURING: LP.06 six leaves visible, LP.04 four leaves visible, LP.08 eight leaves visible; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 19 (TAIR:AT4G23270.1); Has 121765 Blast hits to 118949 proteins in 4447 species: Archae - 102; Bacteria - 13740; Metazoa - 44280; Fungi - 10260; Plants - 35406; Viruses - 410; Other Eukaryotes - 17567 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:12185737..12188763 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 92321.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 830 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSWASFIFL FIFSFLTSFR VFAQDPTYRY HSCPNTTIFS RDSAYFSNLQ TLLSFLSSPD ASSSYSSGFR NDAVGTFPDR VTGLFDCRGD LPPEVCHNCV 101: AFAVKDTLIR CPNERDVTLF YDECTLRYSN LVVTSALDPT YVYHVCPSWA TFPRSSTYMT NLITLLSTLS SPSASYSTGF QNATAGKHPD RVTGLFNCRG 201: DVSPEVCRRC VSFAVNETST RCPIEKEVTL YYDQCTLRYS NRNILSTSNT NGGIILANSQ NMTSNEQARF KDLVLTTMNQ ATIAAANSSK RFDARSANFT 301: TLHSLYTLVQ CTHDLTRQDC LSCLQQIINQ LPTEKIGGQF IVPSCSSRFE LCLFYNQSAV TTPQPQQNSA PPPPPTSIPS PRPGLNSRFP LITCLSAVSF 401: EKFKDLLKPG FICILIKIVS ENTGKGGNSS VIIIAVVVSI TALLLLFVAV FSVRTKRRKK MIGAIPLLNV KRKDTEVTEP LAENGDSITT AGSLQFDFKA 501: IVAATNNFLP INKLGQGGFG EVYKGTFPSG VQVAVKRLSK TSGQGEREFE NEVVVVAKLQ HRNLVRLLGY CLEGEEKILV YEFVHNKSLD YFLFDTTMKR 601: QLDWTRRYKI IGGIARGILY LHQDSRLTII HRDLKAGNIL LDADMNPKVA DFGMARIFGM DQTEANTRRV VGTYGYMAPE YAMYGQFSMK SDVYSFGVLV 701: FEIISGMKNS SLYQMDDSVS NLVTYTWRLW SNGSQLDLVD PSFGDNYQTH DITRCIHIAL LCVQEDVDDR PNMSAIVQML TTSSIVLAVP KQPGFFFRGR 801: HEQVGEVGSS VDRLALCSID DASITSVAPR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)