AT4G22100.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.985 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : beta glucosidase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
beta glucosidase 2 (BGLU3); FUNCTIONS IN: cation binding, hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds, catalytic activity; INVOLVED IN: carbohydrate metabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycoside hydrolase, family 1 (InterPro:IPR001360), Glycoside hydrolase, family 1, active site (InterPro:IPR018120), Glycoside hydrolase, catalytic core (InterPro:IPR017853), Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core (InterPro:IPR013781); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glycosyl hydrolase superfamily protein (TAIR:AT1G45191.2); Has 11206 Blast hits to 10915 proteins in 1473 species: Archae - 143; Bacteria - 7744; Metazoa - 687; Fungi - 200; Plants - 1442; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 990 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:11707370..11709932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57310.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 507 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MELTLSLLTI FLLFFALSGR CSDKNDFPEG FIFGSATSAY QWEGAFDEDG RKPSVWDTFL HTRNLSNGDI TSDGYHKYKE DVKLMVETGL DAFRFSISWS 101: RLIPNGRGPV NPKGLQFYKN FIQELVSHGI EPHVTLFHYD HPQYLEDEYG GWINRRIIQD FTAYANVCFR EFGHHVKFWT TINEANIFTI GGYNDGITPP 201: GRCSSPGRNC SSGNSSTEPY IVGHNLLLAH ASASRLYKQK YKDMQGGSVG FSLFSLGFTP STSSKDDDIA VQRAKDFYFG WMLEPFIFGD YPDEMKRTVG 301: SRLPVFSKEE SEQVKGSSDF IGIIHYLAAS VTSIKIKPSI SGNPDFYSDM GVSMTWTVLG NFSAFEYAVA PWAMESVLEY IKQSYGNPPI YILENGTPMK 401: QDLQLQQKDT PRIEYLHAYI AAVLKSIRNG SDTRGYFIWS FMDLYELVKG YEFSFGLYSV NFSDPHRTRS PKLSAHWYSA FLKGNTTFLG SQGIMQMQSN 501: FSSSASS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)