AT4G21690.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.989 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : gibberellin 3-oxidase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
gibberellin 3-oxidase 3 (GA3OX3); FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, iron ion binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: sperm cell, flower, anther, terminal floral bud; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Isopenicillin N synthase (InterPro:IPR002283), Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase (InterPro:IPR005123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: gibberellin 3-oxidase 1 (TAIR:AT1G15550.1); Has 8031 Blast hits to 7999 proteins in 991 species: Archae - 0; Bacteria - 1108; Metazoa - 82; Fungi - 819; Plants - 4860; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1162 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:11527229..11529060 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39213.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 349 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSVTQLFKN NPVNRDRIIP LDFTNTKTLP DSHVWSKPEP ETTSGPIPVI SLSNPEEHGL LRQACEEWGV FHITDHGVSH SLLHNVDCQM KRLFSLPMHR 101: KILAVRSPDE STGYGVVRIS MFYDKLMWSE GFSVMGSSLR RHATLLWPDD HAEFCNVMEE YQKAMDDLSH RLISMLMGSL GLTHEDLGWL VPDKTGSGTD 201: SIQSFLQLNS YPVCPDPHLA MGLAPHTDSS LLTILYQGNI PGLEIESPQE EGSRWIGVEP IEGSLVVIMG DLSHIISNGQ FRSTMHRAVV NKTHHRVSAA 301: YFAGPPKNLQ IGPLTSDKNH PPIYRRLIWE EYLAAKATHF NKALTLFRC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)