AT4G21410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cysteine-rich receptor-like protein kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 29 (CRK29); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: response to abscisic acid stimulus; LOCATED IN: plasma membrane, vacuole; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 28 (TAIR:AT4G21400.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:11402463..11405025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 75724.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 679 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEHVRVIFFF ACFLTLAPFH AFAQVDSYEF DPDFNCVDRG NFTANSTFAG NLNRLVSSLS SLKSQAYGFY NLSSGDSSGE RAYAIGLCRR EVKRDDCVSC 101: IQTAARNLTK QCPLTKQAVV WYTHCMFRYS NRTIYGRKET NPTKAFIAGE EISANRDDFE RLQRGLLDRL KGIAAAGGPN RKYAQGNGSA SAGYRRFYGT 201: VQCTPDLSEQ DCNDCLVFGF ENIPSCCDAE IGLRWFSPSC NFRFETWRFY EFDADLEPDP PAIQPADSPQ SAARTERTGK GKGGSKVIIA IVIPILLVAL 301: LAICLCLVLK WRKNKSGYKN KVLGKSPLSG SIAEDEFSNT ESLLVHFETL KTATDNFSSE NELGRGGFGS VYKGVFPQGQ EIAVKRLSGN SGQGDNEFKN 401: EILLLAKLQH RNLVRLIGFC IQGEERLLVY EFIKNASLDQ FIFDTEKRQL LDWVVRYKMI GGIARGLLYL HEDSRFRIIH RDLKASNILL DQEMNPKIAD 501: FGLAKLFDSG QTMTHRFTSR IAGTYGYMAP EYAMHGQFSV KTDVFSFGVL VIEIITGKRN NNGGSNGDED AEDLLSWVWR SWREDTILSV IDPSLTAGSR 601: NEILRCIHIG LLCVQESAAT RPTMATVSLM LNSYSFTLPT PLRPAFVLES VVIPSNVSSS TEGLQMSSND VTVSEFSPR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)