AT4G21200.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.796 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : gibberellin 2-oxidase 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with gibberellin 2-oxidase activity which acts specifically on C-20 gibberellins. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
gibberellin 2-oxidase 8 (GA2OX8); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase (InterPro:IPR005123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: gibberellin 2-oxidase 7 (TAIR:AT1G50960.1); Has 8586 Blast hits to 8547 proteins in 1007 species: Archae - 0; Bacteria - 1133; Metazoa - 115; Fungi - 1020; Plants - 4926; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1392 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:11302751..11306601 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39088.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 338 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDPPFNEIYN NLLYNQITKK DNDVSEIPFS FSVTAVVEEV ELPVIDVSRL IDGAEEEREK CKEAIARASR EWGFFQVINH GISMDVLEKM RQEQIRVFRE 101: PFDKKSKSEK FSAGSYRWGT PSATSIRQLS WSEAFHVPMT DISDNKDFTT LSSTMEKFAS ESEALAYMLA EVLAEKSGQN SSFFKENCVR NTCYLRMNRY 201: PPCPKPSEVY GLMPHTDSDF LTILYQDQVG GLQLIKDNRW IAVKPNPKAL IINIGDLFQA WSNGMYKSVE HRVMTNPKVE RFSTAYFMCP SYDAVIECSS 301: DRPAYRNFSF REFRQQVQED VKKFGFKVGL PRFLNHVY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)