AT4G21000.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.645 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha carbonic anhydrase 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
alpha carbonic anhydrase 6 (ACA6); FUNCTIONS IN: carbonate dehydratase activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: one-carbon metabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Carbonic anhydrase, alpha-class, catalytic domain (InterPro:IPR001148), Carbonic anhydrase, CAH1-like (InterPro:IPR018340), Carbonic anhydrase, alpha-class, conserved site (InterPro:IPR018338); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha carbonic anhydrase 4 (TAIR:AT4G20990.1); Has 3246 Blast hits to 3235 proteins in 536 species: Archae - 0; Bacteria - 711; Metazoa - 1969; Fungi - 83; Plants - 321; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 162 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:11222529..11223756 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29949.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 260 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDANTKTILF FVVFFIDLFS PNILFVYARE IGNKPLFTYK QKTEKGPAEW GKLDPQWKVC STGKIQSPID LTDERVSLIH DQALSKHYKP ASAVIQSRGH 101: DVMVSWKGDG GKITIHQTDY KLVQCHWHSP SEHTINGTSY DLELHMVHTS ASGKTTVVGV LYKLGEPDEF LTKILNGIKG VGKKEIDLGI VDPRDIRFET 201: NNFYRYIGSL TIPPCTEGVI WTVQKRVLYF FCFCYRLIIF VTPYINIFWI FVFVFWCMLM |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)