AT4G20990.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.565 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha carbonic anhydrase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
alpha carbonic anhydrase 4 (ACA4); FUNCTIONS IN: carbonate dehydratase activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: one-carbon metabolic process; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane; EXPRESSED IN: pollen tube; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Carbonic anhydrase, alpha-class, catalytic domain (InterPro:IPR001148), Carbonic anhydrase, alpha-class, conserved site (InterPro:IPR018338), Carbonic anhydrase, CAH1-like (InterPro:IPR018340); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha carbonic anhydrase 6 (TAIR:AT4G21000.1); Has 3359 Blast hits to 3345 proteins in 546 species: Archae - 0; Bacteria - 694; Metazoa - 2070; Fungi - 83; Plants - 327; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 181 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:11219772..11221126 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30594.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 267 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDTNAKTIFF MAMCFIYLSF PNISHAHSEV DDETPFTYEQ KTEKGPEGWG KINPHWKVCN TGRYQSPIDL TNERVSLIHD QAWTRQYKPA PAVITNRGHD 101: IMVSWKGDAG KMTIRKTDFN LVQCHWHSPS EHTVNGTRYD LELHMVHTSA RGRTAVIGVL YKLGEPNEFL TKLLNGIKAV GNKEINLGMI DPREIRFQTR 201: KFYRYIGSLT VPPCTEGVIW TVVKRVNTIS MEQITALRQA VDDGFETNSR PVQDSKGRSV WFYDPNV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)