AT4G19040.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.606 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a PH and START domain-containing protein that mediates resistance to pathogenic fungi. Resistance requires salicylic acid signalling. Mutants are resistant to E. cichoracearum. Expressed throughout plant tissues and possibly localized to membranes /mitochondrion. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2 (EDR2); FUNCTIONS IN: lipid binding; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF1336 (InterPro:IPR009769), Pleckstrin homology-type (InterPro:IPR011993), Lipid-binding START (InterPro:IPR002913), Pleckstrin homology (InterPro:IPR001849); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pleckstrin homology (PH) domain-containing protein / lipid-binding START domain-containing protein (TAIR:AT5G45560.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:10431799..10437171 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 82513.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 724 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSKVVYEGWM VRYGRRKIGR SYIHMRYFVL EPRLLAYYKK KPQDYQVPIK TMLIDGNCRV EDRGLKTHHG HMVYVLSVYN KKEKSHRITM AAFNIQEALM 101: WKEKIESVID QHQESQVPNG QQYVSFEYKS GMDTGRTASS SDHESQSAIS FRFSAAEDEE DSRRSLMRRT TIGNGPPESV LDWTKEFDAE LANQNSDNQA 201: FSRKHWRLLQ CQNGLRIFEE LLEVDYLPRS CSRAMKAVGV VEATCEEIFE LLMSMDGTRY EWDCSFQFGS LVEEVDGHTA VLYHRLLLDW FPMIVWPRDL 301: CYVRYWRRND DGSYVVLFRS REHENCGPQP GCVRAHLESG GYNISPLKPR NGRPRTQVQH LIQIDLKGWG AGYLPAFQQH CLLQMLNSVA GLREWFSQTD 401: ERGVHTRIPV MVNMASSSLS LTKSGKSLHK SAFSLDQTNS VNRNSLLMDE DSDDDDEFQI AESEQEPETS KPETDVKRPE EEPAHNIDLS CFSGNLKRNE 501: NENARNCWRI SDGNNFKVRG KNFGQEKRKI PAGKHLMDLV AVDWFKDSKR IDHVARRKGC AAQVAAEKGL FSMVVNVQVP GSTHYSMVFY FVMKELVPGS 601: LLQRFVDGDD EFRNSRLKLI PLVPKGSWIV RQSVGSTPCL LGKAVDCNYI RGPTYLEIDV DIGSSTVANG VLGLVIGVIT SLVVEMAFLV QANTAEEQPE 701: RLIGAVRVSH IELSSAIVPN LESE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)