AT4G16500.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cystatin/monellin superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cystatin/monellin superfamily protein; FUNCTIONS IN: enzyme regulator activity, cysteine-type endopeptidase inhibitor activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cell wall, vacuole; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Proteinase inhibitor I25, cystatin (InterPro:IPR000010), Proteinase inhibitor I25, cystatin, conserved region (InterPro:IPR020381); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cystatin/monellin superfamily protein (TAIR:AT5G47550.1); Has 714 Blast hits to 692 proteins in 89 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 5; Fungi - 0; Plants - 705; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:9301530..9301883 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 12556.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 117 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMMKSLICLS LILLPLVSVV EGLGGGGGLG SRKPIKNVSD PDVVAVAKYA IEEHNKESKE KLVFVKVVEG TTQVVSGTKY DLKIAAKDGG GKIKNYEAVV 101: VEKLWLHSKS LESFKAL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)