AT4G16155.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : dihydrolipoyl dehydrogenases | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
dihydrolipoyl dehydrogenases; FUNCTIONS IN: dihydrolipoyl dehydrogenase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction, cell redox homeostasis; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase (InterPro:IPR013027), Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I, active site (InterPro:IPR012999), Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation (InterPro:IPR004099), FAD/NAD-linked reductase, dimerisation (InterPro:IPR016156), Dihydrolipoamide dehydrogenase (InterPro:IPR006258), Mercuric reductase (InterPro:IPR000815), Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, NAD-binding region (InterPro:IPR001327); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: lipoamide dehydrogenase 1 (TAIR:AT3G16950.1); Has 29334 Blast hits to 29301 proteins in 3032 species: Archae - 559; Bacteria - 20043; Metazoa - 811; Fungi - 377; Plants - 519; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 7025 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:9153570..9157322 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 67094.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.84 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 630 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSELDIIAG NFEISGLKTR NVTRVISALI SPPPLVGVRL VQTCHLRHSL FLYTDLSFTL SYTMQSVLSL SFSQASLPLA NRTLCSSNAA PSTPRNLRFC 101: GLRREAFCFS PSKQLTSCRF HIQSRRIEVS AAASSSAGNG APSKSFDYDL IIIGAGVGGH GAALHAVEKG LKTAIIEGDV VGGTCVNRGC VPSKALLAVS 201: GRMRELQNEH HMKAFGLQVS AAGYDRQGVA DHASNLATKI RNNLTNSMKA LGVDILTGFG AVLGPQKVKY GDNIITGKDI IIATGSVPFV PKGIEVDGKT 301: VITSDHALKL ESVPDWIAIV GSGYIGLEFS DVYTALGSEV TFIEALDQLM PGFDPEISKL AQRVLINTRK IDYHTGVFAS KITPAKDGKP VLIELIDAKT 401: KEPKDTLEVD AALIATGRAP FTNGLGLENI NVTTQRGFIP VDERMRVIDG NGKLVPHLYC IGDANGKLML AHAASAQGIS VVEQVTGRDH VLNHLSIPAA 501: CFTHPEISMV GLTEPQAREK AEKEGFKVSI AKTSFKANTK ALAENEGEGL AKMIYRPDNG EILGVHIFGL HAADLIHEAS NAIALGTRIQ DIKLAVHAHP 601: TLSEVVDELF KAAKVDSPAS VTAQSVKVTV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)