AT4G15165.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.991 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein; FUNCTIONS IN: endopeptidase activity, threonine-type endopeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis involved in cellular protein catabolic process, ubiquitin-dependent protein catabolic process; LOCATED IN: proteasome core complex, proteasome core complex, alpha-subunit complex; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Proteasome, alpha-subunit, conserved site (InterPro:IPR000426), Proteasome, subunit alpha/beta (InterPro:IPR001353); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: 20S proteasome alpha subunit C1 (TAIR:AT3G22110.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:8649460..8650212 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22732.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 208 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSRRYDSRTT IFSPEGRLYQ VEYAMEAIGN AGSAIGILAK DGVVLVGEKK VTSKLLQTSS SMEKMYKIDD HVACAVAGIM SDANILINTA RVQAQRWDRN 101: HGFQLYMSDP SGNYGGWQAA AVGANNQAAQ SILKQDYKDD ATREEVVQLA IKVLSKTMDS TSLTAEKLEL AELYLTPSKC VKYHVHSPDS LTKLLVKHGV 201: TQPAAETS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)