AT4G14490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.996 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : SMAD/FHA domain-containing protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
SMAD/FHA domain-containing protein ; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: SMAD/FHA domain (InterPro:IPR008984), Forkhead-associated (FHA) domain (InterPro:IPR000253); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: SMAD/FHA domain-containing protein (TAIR:AT3G02400.1); Has 1713 Blast hits to 1668 proteins in 445 species: Archae - 15; Bacteria - 1228; Metazoa - 80; Fungi - 66; Plants - 132; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 192 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:8332414..8333574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43370.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 386 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVTPSLRLVF VKGPREGDAL DYKPGSTIRV GRIVRGNEIA IKDAGISTKH LRIESDSGNW VIQDLGSSNG TLLNSNALDP ETSVNLGDGD VIKLGEYTSI 101: LVNFVIDDFQ EKKLTRNNRR QANARKRIRV LESINLGDIT EEEKGLDVKF ENKPSSRVRK VRKIEDSEKL GITDGLQEDL VEKNGSFRNV ESIQSSSVNL 201: IKVEMEDCAM VEENLGRGLK KRVSSKATRS KKIEESVGKA CLGVVNVEKV ETLKEKRITR ATRSKKIDIV GDSYLELDMV LNRARKNKGK NKKADQKPLK 301: SFENDEVTDS GEQGLSCHVE EDMNNELDTD LRKMTLGALF SFLEGHLSKE IIHKTENMIE PMRSKTQRVR EYISDQRKVQ AKACMC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)