AT4G14340.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.900 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : casein kinase I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Phosphorylates serine or threonine residues that are near and C-terminal to acidic side chains on a variety of target proteins | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
casein kinase I (CKI1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: casein kinase I-like 10 (TAIR:AT3G23340.1); Has 58467 Blast hits to 58136 proteins in 2224 species: Archae - 39; Bacteria - 9706; Metazoa - 21949; Fungi - 6340; Plants - 9653; Viruses - 309; Other Eukaryotes - 10471 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:8248532..8251668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51955.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 457 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDRNQKMDHV IGGKFKLGRK LGSGSFGELY LGINIQTGEE VAVKLEPVKT RHPQLQYESK IYMFLQGGTG VPHLKWFGVE GEYSCMVIDL LGPSLEDLFN 101: YCKRIFSLKS VLMLADQLIC RVEYMHSRGF LHRDIKPDNF LMGLGRRANQ VYIIDYGLAK KYKDLQTQKH IPYRENKNLT GTARYASVNT HLGIEQSRRD 201: DLESLGYVLM YFLRGSLPWQ GLKAGTKKQK YDKISEKKML TSVETLCKSY PSEFTSYFHY CRSLRFEDKP DYSYLRRLFR DLFIREGYQL DYVFDWTISK 301: YPQIGSSSRP RPTPRPALDP PGPPAERAEK PTVGQDLRGR FTGAIEAFTR RNVSSQGALG DRSRHRSSDD IPSSAKEVHE SRNGSTSKRG VISSTRPGSS 401: AEPSENHSSR LFSSGSRHAT TQRVPQSYES AAAARPGHED AIRNFELLTI GSGKKRK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)