AT4G14320.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.997 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Zinc-binding ribosomal protein family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Zinc-binding ribosomal protein family protein; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: ribosome, cytosolic large ribosomal subunit; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L44e (InterPro:IPR000552), Ribosomal protein, zinc-binding domain (InterPro:IPR011332); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Zinc-binding ribosomal protein family protein (TAIR:AT3G23390.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:8241841..8243805 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17259.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 154 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVNIPKTKNT YCKNKECKKH TLHKVTQYKK GKDSLAAQGK RRYDRKQSGY GGQTKPVFHK KAKTTKKIVL RLQCQSCKHF SQRPIKRCKH FEIVLIESCA 101: GKMVDEMIFS CVCCGGPGCC GDRGEGPVGG GIDNEPVNVV VVVVEPGSQR RKMW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)