AT4G13700.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : purple acid phosphatase 23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
purple acid phosphatase 23 (PAP23); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine phosphatase activity, acid phosphatase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 6 plant structures; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Purple acid phosphatase, N-terminal (InterPro:IPR015914), Metallophosphoesterase (InterPro:IPR004843), Purple acid phosphatase-like, N-terminal (InterPro:IPR008963); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: purple acid phosphatase 15 (TAIR:AT3G07130.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:7957072..7958919 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51587.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.83 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 458 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTLLIMITLT SISLLLAAAE TIPTTLDGPF KPLTRRFEPS LRRGSDDLPM DHPRLRKRNV SSDFPEQIAL ALSTPTSMWV SWVTGDAIVG KDVKPLDPSS 101: IASEVWYGKE KGNYMLKKKG NATVYSQLYP SDGLLNYTSG IIHHVLIDGL EPETRYYYRC GDSSVPAMSE EISFETLPLP SKDAYPHRIA FVGDLGLTSN 201: TTTTIDHLME NDPSLVIIVG DLTYANQYRT IGGKGVPCFS CSFPDAPIRE TYQPRWDAWG RFMEPLTSKV PTMVIEGNHE IEPQASGITF KSYSERFAVP 301: ASESGSNSNF YYSFDAGGVH FVMLGAYVDY NNTGLQYAWL KEDLSKVDRA VTPWLVATMH PPWYNSYSSH YQEFECMRQE MEELLYQYRV DIVFAGHVHA 401: YERMNRIYNY TLDPCGPVYI TIGDGGNIEK VDVDFADDPG KCHSSYDLFF FNSLNLSN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)