AT4G12170.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.664 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Thioredoxin superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Thioredoxin superfamily protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: cell redox homeostasis; LOCATED IN: cellular_component unknown; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Thioredoxin, core (InterPro:IPR015467), Thioredoxin domain (InterPro:IPR013766), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: thioredoxin family protein (TAIR:AT1G52990.1); Has 6386 Blast hits to 6372 proteins in 1906 species: Archae - 79; Bacteria - 4218; Metazoa - 281; Fungi - 299; Plants - 438; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1071 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:7273997..7274727 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 14494.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 128 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MCSGSDSDPF IKAYVSSSLP SHDGLVQSLS ASEWNSLVIQ SKVPVIVVFI AKDCAECGSL MPELEFLDSE YEYMLKFYTV DTDEELELAK DYRIEYHPIT 101: IVFKGGEEKE RVLGYYPQML GQLANKYL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)