AT4G11480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cysteine-rich receptor-like protein kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 32 (CRK32); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 31 (TAIR:AT4G11470.1); Has 119490 Blast hits to 117914 proteins in 4533 species: Archae - 87; Bacteria - 13209; Metazoa - 44379; Fungi - 10126; Plants - 33645; Viruses - 415; Other Eukaryotes - 17629 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:6971408..6973799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 73699.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 656 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MCLQNLLSIL CFVLAISFGY VSAQKCVDSM FFRPNGTYDT NRHLILSNLA SNVSSRDGYY NGSVGEGPDR IYALGLCIPG TDPKVCDDCM QIASTGILQN 101: CPNQTDSYDW RSQKTLCFVR YSNSSFFNKM DLEPTMVIGD LNSGLFQGDL AAYTRTWEEF MNSMITRVGR TRYLADISPR IGSARIYALM QCIRGISSME 201: CETCIRDNVR MYQSCCNGFI GGTIRKPVCF FRWDGSEYLG AFGDTPSLPP PSPDGKTIST GAIVAVVVSV VIFVVLLALV LVIRKRRQSY KTLKPKTDDD 301: MTSPQSLQFD FMTLEAATDK FSRNNKLGKG GFGEVYKGML PNETEVAVKR LSSNSGQGTQ EFKNEVVIVA KLQHKNLVRL LGFCLERDEQ ILVYEFVPNK 401: SLNYFLFGNK QKHLLDPTKK SQLDWKRRYN IIGGITRGLL YLHQDSRLTI IHRDIKASNI LLDADMNPKI ADFGMARNFR VDQTEDNTRR VVGTFGYMPP 501: EYVTHGQFST KSDVYSFGVL ILEIVCGKKN SSFYKIDDSG GNLVTHVWRL WNNDSPLDLI DPAIEESCDN DKVIRCIHIG LLCVQETPVD RPEMSTIFQM 601: LTNSSITLPV PRPPGFFFRN RSNLDPLTYG SELGQSSSKS IPYTIDSASI TRVTPR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)