AT4G11470.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cysteine-rich receptor-like protein kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 31 (CRK31); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: cotyledon; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 32 (TAIR:AT4G11480.1); Has 120832 Blast hits to 119169 proteins in 4439 species: Archae - 88; Bacteria - 13747; Metazoa - 44536; Fungi - 10306; Plants - 33929; Viruses - 433; Other Eukaryotes - 17793 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:6967729..6970161 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 74678.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 666 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MCLNTLCAIL CFVLTVSFGF VSAQKCGESV FFRPNGNYDT NRRLVLSTLA SNVSSQNNRF YNVSVGEGAG RIYALGLCIP GSDPRVCSDC IQLASQGLLQ 101: TCPNQTDSFY WTGDNADKTL CFVRYSNNSF FNKMALEPTH AVYNTMRFQG NLTAYTRTWD AFMNFMFTRV GQTRYLADIS PRINQEPLSP DLIYALMQCI 201: PGISSEDCET CLGKCVDDYQ SCCNGFIGGV VNKPVCYFRW DGYKYYGAFG DEAPSQPPTP LPLPPPPPRD PDGKKISTGV IVAIVVSAVI FVVLVALGLV 301: IWKRRQSYKT LKYHTDDDMT SPQSLQFDFT TIEVATDNFS RNNKLGQGGF GEVYKGMLPN ETEIAVKRLS SNSGQGTQEF KNEVVIVAKL QHKNLVRLLG 401: FCIERDEQIL VYEFVSNKSL DYFLFDPKMK SQLDWKRRYN IIGGVTRGLL YLHQDSRLTI IHRDIKASNI LLDADMNPKI ADFGMARNFR VDQTEDQTGR 501: VVGTFGYMPP EYVTHGQFST KSDVYSFGVL ILEIVCGKKN SSFFQMDDSG GNLVTHVWRL WNNDSPLDLI DPAIKESYDN DEVIRCIHIG ILCVQETPAD 601: RPEMSTIFQM LTNSSITLPV PRPPGFFFRN RPNLDPLTYG SEQGQSSSMS VPFSIDSASI TRATPR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)