AT4G10720.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.432 golgi 0.236 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ankyrin repeat family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ankyrin repeat family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ankyrin repeat-containing domain (InterPro:IPR020683), Ankyrin repeat (InterPro:IPR002110); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ankyrin repeat family protein (TAIR:AT5G54620.1); Has 21854 Blast hits to 10883 proteins in 482 species: Archae - 19; Bacteria - 1460; Metazoa - 11922; Fungi - 1177; Plants - 2352; Viruses - 52; Other Eukaryotes - 4872 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:6607879..6609358 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49714.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.98 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 445 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDPRLIVATQ IGSIDELYAH IHENPYILEI IDAIPFINTP LHIASASGNL SFAMELMNLK PSFARKLNTY GLSPLHLAIE EGQTRLVLSL LKVDSDLVRL 101: RGREGMTPFH QVVRRGETDL MTEFLLACPG CIKDANVNGE TALHIAVSND RYEELEVLLG WVQRLRQTDA ESLEMQFLNK RDQDGNTALH IAAYQNRFKA 201: VKILVKCSAV NRNIHNRTGL TALDILHNQR DHHANSNIEN IIRKWGGKSG NSLPKSKKVS EILRSPISFT EHLFTQTARY RNQTSEGTRS ALLVIAALII 301: TATYQTALQP PGGVYQENAA EESKKSVGTV VMSHKYFFVL RGVNTMAFVG AIFMAFCLLP AGEGYVWWFL WIAVPLYVSY LVSMSVISPD TVWYVSTNAG 401: SVIIVVFAYM VVFFLRWKRS KKKVPGTSSE LILEGLTTLD LAKGS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)