AT4G10440.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.551 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF248, methyltransferase putative (InterPro:IPR004159); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein (TAIR:AT1G33170.1); Has 1162 Blast hits to 1152 proteins in 127 species: Archae - 5; Bacteria - 186; Metazoa - 0; Fungi - 2; Plants - 957; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 12 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:6459728..6461932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 72391.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 633 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAKENSGHHH QTEARRKKLT LILGVSGLCI LFYVLGAWQA NTVPSSISKL GCETQSNPSS SSSSSSSSES AELDFKSHNQ IELKETNQTI KYFEPCELSL 101: SEYTPCEDRQ RGRRFDRNMM KYRERHCPVK DELLYCLIPP PPNYKIPFKW PQSRDYAWYD NIPHKELSVE KAVQNWIQVE GDRFRFPGGG TMFPRGADAY 201: IDDIARLIPL TDGGIRTAID TGCGVASFGA YLLKRDIMAV SFAPRDTHEA QVQFALERGV PAIIGIMGSR RLPYPARAFD LAHCSRCLIP WFKNDGLYLM 301: EVDRVLRPGG YWILSGPPIN WKQYWRGWER TEEDLKKEQD SIEDVAKSLC WKKVTEKGDL SIWQKPLNHI ECKKLKQNNK SPPICSSDNA DSAWYKDLET 401: CITPLPETNN PDDSAGGALE DWPDRAFAVP PRIIRGTIPE MNAEKFREDN EVWKERIAHY KKIVPELSHG RFRNIMDMNA FLGGFAASML KYPSWVMNVV 501: PVDAEKQTLG VIYERGLIGT YQDWCEGFST YPRTYDMIHA GGLFSLYEHR CDLTLILLEM DRILRPEGTV VLRDNVETLN KVEKIVKGMK WKSQIVDHEK 601: GPFNPEKILV AVKTYWTGQP SDKNNNNNNN NNN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)