AT4G10260.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.996 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : pfkB-like carbohydrate kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
pfkB-like carbohydrate kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity, ribokinase activity; INVOLVED IN: D-ribose metabolic process, acetate fermentation, sucrose biosynthetic process, sucrose catabolic process, using beta-fructofuranosidase; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: petal, leaf whorl, sepal, male gametophyte, flower; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Carbohydrate/purine kinase (InterPro:IPR011611), Ribokinase (InterPro:IPR002139), Carbohydrate/puine kinase, PfkB, conserved site (InterPro:IPR002173); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: pfkB-like carbohydrate kinase family protein (TAIR:AT3G59480.1); Has 19547 Blast hits to 19543 proteins in 2443 species: Archae - 410; Bacteria - 14542; Metazoa - 141; Fungi - 136; Plants - 489; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3829 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:6371486..6372770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34689.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 324 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MANTPLIVSF GEMLIDFVPD TSGVSLAEST GFLKAPGGAP ANVACAITKL GGKSAFIGKF GDDEFGHMLV NILKKNGVNS EGVCFDTNAR TALAFVTLKK 101: DGEREFMFYR NPSADMLLKE SELNKDLIKK AKIFHYGSIS LISEPCRTAH MAAMKTAKDA GVLLSYDPNV RLPLWPSTEA AIEGIKSIWN EADIIKVSDD 201: EVTFLTRGDA EKDDVVLSLM HDKLKLLIVT DGEKGCRYYT KKFKGRVPGY AVKAVDTTGA GDSFVGAFLV SLGKDGSILD DEGKLKEALA FANACGAVCT 301: TQKGAIPALP TPADAQKLMK SKSK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)