AT4G09740.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 ASURE: extracellular What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glycosyl hydrolase 9B14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
glycosyl hydrolase 9B14 (GH9B14); FUNCTIONS IN: hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds, catalytic activity; INVOLVED IN: carbohydrate metabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Six-hairpin glycosidase (InterPro:IPR012341), Glycoside hydrolase, family 9, active site (InterPro:IPR018221), Six-hairpin glycosidase-like (InterPro:IPR008928), Glycoside hydrolase, family 9 (InterPro:IPR001701); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glycosyl hydrolase 9B15 (TAIR:AT4G23560.1); Has 1884 Blast hits to 1872 proteins in 267 species: Archae - 2; Bacteria - 724; Metazoa - 173; Fungi - 19; Plants - 922; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 44 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:6142706..6145003 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52516.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 478 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKLLVVMLI GMFLAFESLE ALDYGDALNK SILFFEGQRS GKLPTNQRVK WRADSGLSDG ASANVNLIGG YYDAGDNVKF VWPMSFTTTL LSWAALEYQN 101: EITFVNQLGY LRSTIKWGTN FILRAHTSTN MLYTQVGDGN SDHSCWERPE DMDTPRTLYS ISSSSPGSEA AGEAAAALAA ASLVFKLVDS TYSSKLLNNA 201: KSLFEFADKY RGSYQASCPF YCSHSGYQDE LLWAAAWLYK ATGEKSYLNY VISNKDWSKA INEFSWDNKF AGVQALLASE FYNGANDLEK FKTDVESFVC 301: ALMPGSSSQQ IKPTPGGILF IRDSSNLQYV TTATTILFYY SKTLTKAGVG SIQCGSTQFT VSQIRNFAKS QVDYILGNNP LKMSYMVGFG TKYPTQPHHR 401: GSSLPSIQSK PEKIDCNGGF SYYNFDTPNP NVHTGAIVGG PNSSDQYSDK RTDYSHAEPT TYINAAFIGS VAALISSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)