AT4G05475.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.855 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : RNI-like superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
RNI-like superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: F-box domain, cyclin-like (InterPro:IPR001810); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: RNI-like superfamily protein (TAIR:AT4G05470.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:2765962..2767957 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35380.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 309 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATSTTLQSL LMKEDEEQRN KRRTTSTMFL KKDDEERINW VDLPPELTTS ILLRLSVTDI LDNARKLCRA WRRICKDPSM WRKINLRDCL MYEFDFESMC 101: RHIVDLSQGG LLEINIEHFV SDSLLSYIVD RSCNLKSLGI SIYEPMTNKG VMNGIEKLPL LETLVIFHSS IKLDLKAIGH ACPQLKTLKL NSLGSELAHD 201: ISQVGYIPLL ECDDDALAIA ESMPKLRHLQ LMGNGLTNTG LNAILDGCPH LEEHLDVRKC FNINLVGNLE KRCMKRIKEL RRPHDSTADY PYSISVSMVV 301: QMMITSRYH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)