AT4G05130.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.846 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : equilibrative nucleoside transporter 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
equilibrative nucleoside transporter 4 (ENT4); FUNCTIONS IN: nucleoside transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: transport; LOCATED IN: membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Delayed-early response protein/equilibrative nucleoside transporter (InterPro:IPR002259), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Major facilitator superfamily protein (TAIR:AT4G05120.1); Has 901 Blast hits to 863 proteins in 185 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 419; Fungi - 101; Plants - 210; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 169 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:2636875..2638965 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46296.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 418 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MADGYENHAP ENLQGKYQAM VVCCILGIGS LFSWNSMLTI ADYYYQVFPD YHPSRVFTLI YQPIALGTIM ILAYRESKIS TRKRILTGYI LFTISTFLLI 101: VLDLTTKGHG GIGHYIVLCT IVASFGLADA TVKGGLVGDL SLMCPELIQS YMAGSGMAGA LTSVLRLITK AAFEKSNNSL RKGAMIFLAI STFIELLCVI 201: LYAYVFPKLP IVKYYRRKAA SEGSKTVVAD LAAAGIQNLS DLSDDDSKNQ MLRKKELLLQ NIDHAVNLFL IYVLTLSIFP GFLYENTGQH GLGDWYALIL 301: VATYNFWDLF GRYAPLVKWL KLENRKALTI AVLTRYFLVP AFYFTAKYGD KGWMIMLVSI LGLTTGHLTV CIMTIAPNGY KGPEKNALGN LLVVFILGGA 401: VVGISLGWLW LIGKKYAF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)