AT4G04710.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : calcium-dependent protein kinase 22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Calcium Dependent Protein Kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
calcium-dependent protein kinase 22 (CPK22); FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, N-terminal protein myristoylation; LOCATED IN: cellular_component unknown; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Calcium-binding EF-hand (InterPro:IPR002048), EF-hand-like domain (InterPro:IPR011992), EF-hand (InterPro:IPR018248), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249), Calcium-dependent protein kinase (InterPro:IPR020642), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: calcium-dependent protein kinase 21 (TAIR:AT4G04720.1); Has 128215 Blast hits to 115900 proteins in 4387 species: Archae - 146; Bacteria - 12831; Metazoa - 47241; Fungi - 17786; Plants - 26994; Viruses - 481; Other Eukaryotes - 22736 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:2389598..2392887 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64678.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 575 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGNCCGSKPL TASDIVSDQK QETILGKPLE DIKKHYSFGD ELGKGKSYAC KSIPKRTLSS EEEKEAVKTE IQIMDHVSGQ PNIVQIKGSY EDNNSIHIVM 101: ELCGGGELFD KIDALVKSHS YYSEKDAAGI FRSIVNAVKI CHSLDVVHRD LKPENFLFSS KDENAMLKAI DFGCSVYIKE GKTFERVVGS KYYIAPEVLE 201: GSYGKEIDIW SAGVILYILL SGVPPFQTGI ESIIVSTLCI VDAEIKECRL DFESQPWPLI SFKAKHLIGK MLTKKPKERI SAADVLEHPW MKSEAPDKPI 301: DNVVLSRMKQ FRAMNKLKKL ALKVIAEGLS EEEIKGLKTM FENMDMDKSG SITYEELKMG LNRHGSKLSE TEVKQLMEAV SADVDGNGTI DYIEFISATM 401: HRHRLERDEH LYKAFQYFDK DGSGHITKEE VEIAMKEHGM GDEANAKDLI SEFDKNNDGK IDYEEFCTMM RNGILQPQGK LLKRLYMNLE ELKTGLTRLG 501: SRLSETEIDK AFQHFDKDNS GHITRDELES AMKEYGMGDE ASIKEVISEV DTDNVSCTLQ HIANISNIKQ VLETL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)