AT4G04470.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 ASURE: peroxisome What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Peroxisomal membrane 22 kDa (Mpv17/PMP22) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
22-kD peroxisomal membrane protein, an integral membrane protein embedded in the lipid bilayer. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PMP22; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mpv17/PMP22 (InterPro:IPR007248); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Peroxisomal membrane 22 kDa (Mpv17/PMP22) family protein (TAIR:AT4G14305.1); Has 1209 Blast hits to 1209 proteins in 184 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 463; Fungi - 362; Plants - 267; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 117 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:2227963..2229226 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21720.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 190 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSSPPKKTT LQRYLSQLQQ HPLRTKAITA GVLSGVSDVV SQKLSGIQKI QLRRVLLKVI FAGGFLGPAG HFFHTYLDKF FKGKKDTQTV AKKVILEQLT 101: LSPLNHLLFM IYYGVVIERT PWTLVRERIK KTYPTVQLTA WTFFPVVGWI NYKYVPLHFR VILHSLVAFF WGIFLTLRAR SMTLALAKAK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)