AT4G04080.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ISCU-like 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a mitochondrial protein similar to E.coli IscU. In bacteria, IscU is a scaffold protein accepting sulfur and iron to build a transient Fe-S cluster,which is subsequently transferred to a target apoprotein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ISCU-like 3 (ISU3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NIF system FeS cluster assembly, NifU, N-terminal (InterPro:IPR002871), ISC system FeS cluster assembly, IscU scaffold (InterPro:IPR011339); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: SufE/NifU family protein (TAIR:AT4G22220.1); Has 5467 Blast hits to 5467 proteins in 1987 species: Archae - 110; Bacteria - 3663; Metazoa - 148; Fungi - 152; Plants - 89; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1305 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:1963386..1964308 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18472.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 171 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLRQTTKRAF LGLASQNPTP FPVVSRLYHP NVIDHYDNPR NVGSFDKNDP NVGTGLVGAP QCGDVMKLQV KFDGSGQIID AKFKTFGCGS AIAASSVATE 101: WVKGKSVEEV LTIKNSQIAK HLSLPPVKLH CSMLAEDAIK AAIKNYKEKQ DKANGETVET IDSTYLHGIG S |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)