AT4G03460.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.954 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ankyrin repeat family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ankyrin repeat family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ankyrin repeat-containing domain (InterPro:IPR020683), Ankyrin repeat (InterPro:IPR002110); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ankyrin repeat family protein (TAIR:AT4G03500.1); Has 31827 Blast hits to 15474 proteins in 712 species: Archae - 44; Bacteria - 2495; Metazoa - 17236; Fungi - 2457; Plants - 2857; Viruses - 141; Other Eukaryotes - 6597 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:1536404..1540111 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 74013.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 677 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLTRDEIVDL RNTTYQSISQ ALWSWFCKHL EILKLGKAFP EPSSIKRQII NMGRSDLDFD RQKKDASSRM FYADETGRTH SLDLSTLFND TSETVPMGPK 101: TIAAVRAGDE TYLRDMKFDV NIALSSVNDH GNTMLHLAAA AGHTDLVCYI LNAYPGLLMK SNSMGEVALH VAAGAGHLAV VEALVSFIKD ISCNKPGVAK 201: KIYFAKDRHQ DNALHVSLKR KHLKVASCLV CAEQSLSFVA NNDGVSPLYL AVEAGQADLA KTMWQHSNNG SSSTSTLASK IGGRSIVHGA MKARRKDILV 301: AILSEDASLI NFRDEGRTCL SFGASLGYYE GFCYLLDKAL DSVYVSDDDG SFPIHMAVKY GYVKILKAIL KRCPDALELL DRENQNVLHV AAKNGKIEVL 401: KFILRCCKDK NKEKLINEED ANGNTPLHLA TKNWHPKVVS MLTWDNRVDL KTLNHDGVTA LDIAEKNMDS SYTFFERLTW MALISAGAPR GPKLILSTPV 501: TQNSDGGKYK DRVNTLLLVA TLVATMTFTA GFTLPGGYNG SVPNFGMATL AKKTAFQVFL VFDTLAMYCS IITIVALIWA QLGDLSLIMK AFNLALPLLG 601: LALTSMSIAF MAGTYAAVYG LLIVGVLTSS YLDFLLLFVN EDDDEKNYTT GSSHTCVKSG ESMGSSSGVQ AEKSKVL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)