AT4G01320.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 ASURE: endoplasmic reticulum What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Peptidase family M48 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
CAAX protease with broad substrate specificity. Localized exclusively to the endoplasmic reticulum. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATSTE24; FUNCTIONS IN: endopeptidase activity, metalloendopeptidase activity; INVOLVED IN: CAAX-box protein maturation, proteolysis; LOCATED IN: endoplasmic reticulum, vacuole; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase M48 (InterPro:IPR001915); Has 2991 Blast hits to 2984 proteins in 996 species: Archae - 162; Bacteria - 1572; Metazoa - 206; Fungi - 172; Plants - 49; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 830 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:545905..549002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48484.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 424 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAIPFMETVV GFMIVMYIFE TYLDLRQLTA LKLPTLPKTL VGVISQEKFE KSRAYSLDKS YFHFVHEFVT ILMDSAILFF GILPWFWKMS GAVLPRLGLD 101: PENEILHTLS FLAGVMTWSQ ITDLPFSLYS TFVIESRHGF NKQTIWMFIR DMIKGTFLSV ILGPPIVAAI IFIVQKGGPY LAIYLWAFMF ILSLVMMTIY 201: PVLIAPLFNK FTPLPDGDLR EKIEKLASSL KFPLKKLFVV DGSTRSSHSN AYMYGFFKNK RIVLYDTLIQ QCKNEDEIVA VIAHELGHWK LNHTTYSFIA 301: VQILAFLQFG GYTLVRNSTD LFRSFGFDTQ PVLIGLIIFQ HTVIPLQHLV SFGLNLVSRA FEFQADAFAV KLGYAKDLRP ALVKLQEENL SAMNTDPLYS 401: AYHYSHPPLV ERLRAIDGED KKTD |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)