AT3G62260.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.517 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein phosphatase 2C family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein phosphatase 2C family protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine phosphatase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: protein amino acid dephosphorylation; LOCATED IN: protein serine/threonine phosphatase complex; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein phosphatase 2C, manganese/magnesium aspartate binding site (InterPro:IPR000222), Protein phosphatase 2C-related (InterPro:IPR001932), Protein phosphatase 2C (InterPro:IPR015655), Protein phosphatase 2C, N-terminal (InterPro:IPR014045); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein phosphatase 2C family protein (TAIR:AT1G48040.1); Has 7565 Blast hits to 7530 proteins in 876 species: Archae - 12; Bacteria - 1215; Metazoa - 1621; Fungi - 781; Plants - 2594; Viruses - 9; Other Eukaryotes - 1333 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:23038516..23040391 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41970.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 384 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVAEAEVVFQ QSLPAVLEIE LFDGVSSAVK SPVSSPKLGF TQSTASVSGS LTTSPVQADI FPEGDCDPSV LDYIPTIRSG SFADIGPKRN MEDEHIRIDD 101: LSSQVGSLFE LPKPSAFYAV FDGHGGPEAA AYVRENAIRF FFEDEQFPQT SEVSSVYVEE VETSLRNAFL QADLALAEDC SISDSCGTTA LTALICGRLL 201: MVANAGDCRA VLCRKGRAID MSEDHKPINL LERRRVEESG GFITNDGYLN EVLAVTRALG DWDLKLPHGS QSPLISEPEI KQITLTEDDE FLVIGCDGIW 301: DVLTSQEAVS IVRRGLNRHN DPTRCARELV MEALGRNSFD NLTAVVVCFM TMDRGDKPVV PLEKRRCFSL SPEAFCSLRN LLDG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)