AT3G61940.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cation efflux family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Zinc transporter (ZAT) family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MTPA1; FUNCTIONS IN: efflux transmembrane transporter activity, zinc ion transmembrane transporter activity, inorganic anion transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: zinc ion transport, cation transport, transmembrane transport; LOCATED IN: membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cation efflux protein (InterPro:IPR002524); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: metal tolerance protein A2 (TAIR:AT3G58810.1); Has 7915 Blast hits to 7375 proteins in 2172 species: Archae - 142; Bacteria - 4983; Metazoa - 1411; Fungi - 534; Plants - 297; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 545 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:22937445..22938449 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37346.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 334 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDSRRSKVCG ETACGFSTSS SDAKKRAASM RKLCFVVVLC LLFMSIEVVC GIKANSLAIL ADAAHLLTDV GAFAISMLSL WASSWEANPR QSYGFFRIEI 101: LGTLVSIQLI WLLTGILVYE AVTRLVQETN DDVDGFFMVL VAAFGLVVNI IMIVVLGHDH GHGHDHGHSH DHGHSYGERA EQLLEKSKEI RNINVQGAYL 201: HVLGDLIQSI GVMIGGGMIW YNPKWKVIDL ICTLFFSVIV LGTTIKMLRS ILEVLMESTP REIDARQLEK GLMEIEEVVD VHELHIWAIT VGKALFSCHV 301: KVRPEAGDEM VLNKVIDYIW REYRISHVTI QIER |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)