AT3G61450.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.924 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : syntaxin of plants 73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
syntaxin of plants 73 (SYP73) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
syntaxin of plants 73 (SYP73); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Target SNARE coiled-coil domain (InterPro:IPR000727), Syntaxin/epimorphin, conserved site (InterPro:IPR006012); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: syntaxin of plants 71 (TAIR:AT3G09740.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:22738455..22739953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29892.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.83 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 264 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGVIDLITRV DSICKKYEKY DINRQRDANV SGDDAFSRLY SAVEYALETV LQKTEDLSSE TNKAKAVAMN AEIRRTKARL LEGIPKLQRL SLKKVKGLSK 101: EELDARNDLV LSLRDKIEAI PESSAPVVGG WEASTSYSNI RFDTNVSDDR IGSEYFQPTG ESDQFKQEYE MKRIKQDQGL DYIAEGLDTL KNMAQDINEE 201: LDRQEPLMDE IDTKIDKAAT DLKSTNVRLK DTVTKLRSSR NFCIDIILLC ILLGIAAFIY NSVK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)