AT3G61320.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Bestrophin-like protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Bestrophin-like protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Bestrophin-like (InterPro:IPR021134); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Bestrophin-like protein (TAIR:AT2G45870.1); Has 1448 Blast hits to 1447 proteins in 512 species: Archae - 0; Bacteria - 1140; Metazoa - 0; Fungi - 113; Plants - 120; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 75 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:22694002..22695474 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46541.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 410 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MYQSMNLSVS SNFTHRSLLE SRFPIFSTGF RKSVNLKPPR VSSGPESNDS GHETLTDKLI HLLRAVPDWA DEIKERGMQQ KRSLYTHEKW VEHRSSLRHV 101: RHLLSSFSSR VILSLIPPVF FFTSVAVVIA SYNSAVALDW LPGIFPILRS SSLPYQLTAP ALALLLVFRT EASYSRYEEG RKAWVGIIAG TNDLARQVIC 201: SVDSSGDELI IKDLLLRYIA AFPVALKCHV IYGSDIARDL RNLIEADDLS LILQAKHRPR CVIEFISQSI QLLKLDDAKR DLLESKMLHL HEGIGVCEQL 301: MGIPIPLSYT RLTSRFLVFW HLTLPIILWD ECHWIVVPAT FISAASLFCI EEVGVLIEEP FPMLALDELC DLVHSNIQEA VKSEKVIRNR IIAKIKLHEF 401: KHSSNGRHRS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)