AT3G60750.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Transketolase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Transketolase; FUNCTIONS IN: catalytic activity, transketolase activity; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Transketolase, N-terminal (InterPro:IPR005474), Transketolase, C-terminal (InterPro:IPR005476), Transketolase, C-terminal/Pyruvate-ferredoxin oxidoreductase, domain II (InterPro:IPR009014), Transketolase-like, pyrimidine-binding domain (InterPro:IPR005475), Transketolase binding site (InterPro:IPR020826), Transketolase, bacterial-like (InterPro:IPR005478), Transketolase-like, C-terminal (InterPro:IPR015941); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Transketolase (TAIR:AT2G45290.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:22454004..22456824 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 79843.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 740 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASTSSLALS QALLARAISH HGSDQRGSLP AFSGLKSTGS RASASSRRRI AQSMTKNRSL RPLVRAAAVE TVEPTTDSSI VDKSVNSIRF LAIDAVEKAK 101: SGHPGLPMGC APMAHILYDE VMRYNPKNPY WFNRDRFVLS AGHGCMLLYA LLHLAGYDSV QEDLKQFRQW GSKTPGHPEN FETPGIEVTT GPLGQGIANA 201: VGLALAEKHL AARFNKPDAE VVDHYTYAIL GDGCQMEGIS NEACSLAGHW GLGKLIAFYD DNHISIDGDT EIAFTENVDQ RFEALGWHVI WVKNGNTGYD 301: EIRAAIKEAK TVTDKPTLIK VTTTIGYGSP NKANSYSVHG AALGEKEVEA TRNNLGWPYE PFQVPDDVKS HWSRHTPEGA TLESDWSAKF AAYEKKYPEE 401: ASELKSIITG ELPAGWEKAL PTYTPESPGD ATRNLSQQCL NALAKVVPGF LGGSADLASS NMTLLKAFGD FQKATPEERN LRFGVREHGM GAICNGIALH 501: SPGLIPYCAT FFVFTDYMRG AMRISALSEA GVIYVMTHDS IGLGEDGPTH QPIEHIASFR AMPNTLMFRP ADGNETAGAY KIAVTKRKTP SILALSRQKL 601: PHLPGTSIEG VEKGGYTISD DSSGNKPDVI LIGTGSELEI AAQAAEVLRK DGKTVRVVSF VCWELFDEQS DEYKESVLPS DVSARVSIEA ASTFGWGKIV 701: GGKGKSIGIN SFGASAPAPL LYKEFGITVE AVVDAAKSFF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)