AT3G59960.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : histone-lysine N-methyltransferase ASHH4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
histone-lysine N-methyltransferase ASHH4 (ASHH4); FUNCTIONS IN: histone-lysine N-methyltransferase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: nucleus; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: SET domain (InterPro:IPR001214), Post-SET domain (InterPro:IPR003616), AWS (InterPro:IPR006560); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: histone-lysine N-methyltransferase ASHH3 (TAIR:AT2G44150.1); Has 5426 Blast hits to 5341 proteins in 477 species: Archae - 2; Bacteria - 423; Metazoa - 2298; Fungi - 546; Plants - 1031; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1126 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:22148334..22150386 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40125.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 352 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSSKKGSDR NQIRKSLRKL KKQIGELEKL ESPDRLNNVK PIFIKRNIYL KKKLKKKVKD HGIFCSCSLD PGSSTLCGSD CNCGILLSSC SSSCKCSSEC 101: TNKPFQQRHI KKMKLVQTEK CGYGIVADED INSGEFIIEY VGEVIDDKIC EERLWKLNHK VETNFYLCQI NWNMVIDATH KGNKSRYINH SCSPNTEMQK 201: WIIDGETRIG IFATRFINKG EQLTYDYQFV QFGADQDCYC GAVCCRKKLG AKPCKTKNTT LEEAVKPVAC KVTWKTPKLL NSEVRETNLD ASGQAWNNHS 301: QRKICCRDCI GAYYTAQMKV LTLVVDIFQV MYEDGVTEII DMCREVWKVV TA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)