AT3G59520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.746 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : RHOMBOID-like protein 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
RHOMBOID-like protein 13 (RBL13); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: RHOMBOID-like protein 15 (TAIR:AT3G58460.2); Has 1791 Blast hits to 1791 proteins in 774 species: Archae - 24; Bacteria - 1315; Metazoa - 107; Fungi - 76; Plants - 130; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 139 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:21992054..21992863 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29642.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 269 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGRPLFYDII EKPATSCIVT LCSVIWFVIQ KKSIGYSQVG LSYETAIEGH YWRMITSALS HISVLHLVFN MSALWSLGVV EQLGHVGLGT AYYLHYTLVL 101: VVFSGVLVIG IYHLLIARFK IDYFRRVTAV GYSCVVFGWM TILSVKQPSS KLNLFGLLSL PISFAPFESL IFTSIIVPQA SFLGHLSGIL VGYAISWGLI 201: GGMNNYWALT MLGWIVVVFV FSLKKSGAYD FSFLEIESLT DASLPSVRFI GNGRTLQASA VPLSGVEVV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)