AT3G59070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.957 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane with DOMON related domain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane with DOMON related domain; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome b561, eukaryote (InterPro:IPR004877), Protein of unknown function DUF568, DOMON-like (InterPro:IPR007613), DOMON related (InterPro:IPR005018), Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane (InterPro:IPR006593); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane with DOMON related domain (TAIR:AT5G48750.1); Has 587 Blast hits to 587 proteins in 87 species: Archae - 0; Bacteria - 7; Metazoa - 93; Fungi - 15; Plants - 452; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 20 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:21832364..21834514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52011.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 466 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLSSRATLV VLCCLFMLIP SFTTAATEQG LHARSRCESY SFNNGKSFRS CTDLLVLNSY LHFNYAQETG VLEIAYHHSN LESSSWISWA INPTSKGMVG 101: AQALVAYRNS TSGVMRAYTS SINSYSPMLQ ESPLSLRVTQ VSAEYSNGEM MIFATLVLPP NTTVVNHLWQ DGPLKEGDRL GMHAMSGDNL KSMASLDLLS 201: GQVTTTKSVN RNMLLVKQIH AIVNALSWGI LMPIGVMAAR YMKNYEVLDP TWFYIHVVCQ TTGYFSGLIG GLGTAIYMAR HTGMRTTLHT VIGLLLFALG 301: FLQILSLKAR PNKDHKYRKY WNWYHHTMGY IVIVLSIYNI YKGLSILQPG SIWKIAYTTI ICCIAAFAVV MEILQFKKRW ARLFFKKSKD VEADQPTVSV 401: DVIGETEKAE RKKASGGIEI QIENYNITKN FMIPSVFVIS YPHTSPPLLA FHSYHHPSTS IAATAA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)