AT3G58810.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 ASURE: vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : metal tolerance protein A2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Member of Zinc transporter (ZAT) family. Contributes to basic cellular Zn tolerance and controls Zn partitioning, particularly under conditions of high rates of Zn influx into the root symplasm. Localizes to the vacuolar membrane. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
metal tolerance protein A2 (MTPA2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cation efflux protein (InterPro:IPR002524); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: zinc transporter of Arabidopsis thaliana (TAIR:AT2G46800.2); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:21750551..21751849 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42930.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 393 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVTPKLHLDL SLTKKMKDHI HEHDHMVQIC GEVSSGETSL VGIKKTCGEA PCGFSDAKTS SIEAQERAAS MRKLLIAVLL CAIFIVVEVV GGIKANSLAI 101: LTDAAHLLSD VAAFAISLFS LWASGWKANP QQSYGFFRIE ILGALVSIQM IWLLAGILVY EAIVRLNNGS GEVEGSLMFA VSAVGLLVNI AMAILLGHDH 201: GHGHGHSHDN GHGHSHDHGH GIAATEHHHD SGHDESQLSD VLIEQKKQRN VNIQGAYLHV LGDSIQSVGV MIGGAIIWYK PEWKILDLIC TLVFSVIVLG 301: TTIGMLRNIL EVLMESTPRE IDPTMLEKGV CEIEEVVAVH ELHIWAITVG KLLLACHVKI RPEAEADMVL DKIIDYIKRE HNISHVTIQI ERQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)