AT3G55590.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Glucose-1-phosphate adenylyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Glucose-1-phosphate adenylyltransferase family protein; FUNCTIONS IN: transferase activity, nucleotidyltransferase activity; INVOLVED IN: biosynthetic process; EXPRESSED IN: sperm cell, flower; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Trimeric LpxA-like (InterPro:IPR011004), Bacterial transferase hexapeptide repeat (InterPro:IPR001451), Nucleotidyl transferase (InterPro:IPR005835); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase family protein (TAIR:AT2G39770.2); Has 28049 Blast hits to 28039 proteins in 2988 species: Archae - 1027; Bacteria - 19713; Metazoa - 435; Fungi - 343; Plants - 435; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 6094 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:20617479..20618881 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39810.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 364 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKALILVGGF GTRLRPLTLS LPKPLVDFAN KPMILHQIEA LKAIGVDEVV LAINYEPEQL LVMSKFSNDV EATLGIKITC SQETEPLGTA GPLALARDKL 101: VDGSGQPFFV LNSDVISDYP LEEMIAFHNA HGGEASIMVT KVDEPSKYGV VVMEEATGRV ERFVEKPKLF VGNKINAGIY LLNPSVLDRI ELRPTSIEKE 201: IFPQIAEAEK LYAMLLPGFW MDIGQPRDYI TGLRLYLDSL RKKSPSKLAT GPHILGNVLV DETAEIGEGC LIGPNVAIGP GCVVESGVRL SHCTVMRGVH 301: VKRYACISSS IIGWHSTVGQ WARVENMSIL GKNVYVCDEI YCNGGVVLHN KEIKSDILKP DIVM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)