AT3G54380.3
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.711 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : SAC3/GANP/Nin1/mts3/eIF-3 p25 family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
SAC3/GANP/Nin1/mts3/eIF-3 p25 family; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: SAC3/GANP/Nin1/mts3/eIF-3 p25 (InterPro:IPR005062); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: SAC3/GANP/Nin1/mts3/eIF-3 p25 family (TAIR:AT3G06290.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:20133985..20136378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39045.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 334 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MILPCIGKRE RVTRERLRDL AVFERLYGNP SKSSTEIAVK KFCRTLSAAD VQASDVRPLP VLEETLRYLL SLLDSKEHPF EVVHDFIFDR TRSIRQDLSI 101: QNLANERVIY LYEEMVKFHV ISHERLQSCS GTSISSMHHL NMEQLAKTLT SLYNIYDANR KPDYIYENEA EFRSLYVLLH LNPSSGVMGE PLSLWFRKLT 201: FALVKSKEIC FVRNLLRLYR MGNYKNFLSR TASEATYLQY CISEHHIREM RLVAVQYINN VCYKLQPYPL LRLSQNLKMK ELDVESLCHE CGLETCTDPD 301: GFTVLPVKQS TFRSPEDKFK VYDLIGIERI KMSI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)