AT3G53840.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase superfamily protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase family protein (TAIR:AT5G02070.1); Has 115602 Blast hits to 114373 proteins in 4609 species: Archae - 101; Bacteria - 12221; Metazoa - 43563; Fungi - 9536; Plants - 32868; Viruses - 453; Other Eukaryotes - 16860 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:19945571..19947719 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 70694.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 639 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MELPWLSLTT FTLSLLIYFS STTQAFKRCP NCGSTRVPYP LSTGLDCGDP GYRIRCDNYG SLWFDTLNGS TNPIKTIDPS GQRFVLRPPG FEQNKCVSVD 101: IKYHGIQLDL NLPFNVSCSN TVIIMNCTKD GLDAYSSQGF NCSDNSLCHK FLNANLEARG NCRGVTSCCW YKTGASVNTY KVYRARPDMC SAYQSFMNLD 201: LTIPVSKWGE PAVEILWEAP REPVCKSQGD CRDLLNSVCS NDSTNLGQKR CFCKKGFQWD SVNAVCEVNR CSKRKSCKRW SNLPLLGGLA GGVGAILIAG 301: FITKTIVSKQ NRRIAGNQSW ASVRKLHRNL LSINSTGLDR IFTGKEIVKA TDNFAKSNLL GFGGFGEVFK GNLDDGTTVA VKRAKLGNEK SIYQIVNEVQ 401: ILCQVSHKNL VKLLGCCIEL EMPVLVYEFV PNGTLFEHIY GGGGGGGGLY DHLPLRRRLM IAHQTAQGLD YLHSSSSPPI YHRDVKSSNI LLDENLDVKV 501: ADFGLSRLGV SDVSHVTTCA QGTLGYLDPE YYLNFQLTDK SDVYSFGVVL FELLTCKKAI DFNREEEDVN LVVFVRKALK EGRLMDVIDP VIGIGATEKE 601: IESMKALGVL AELCVKETRQ CRPTMQVAAK EIENILHGI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)