AT3G52990.2
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.963 What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Pyruvate kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Pyruvate kinase family protein; FUNCTIONS IN: pyruvate kinase activity, magnesium ion binding, potassium ion binding, catalytic activity; INVOLVED IN: glycolysis; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: guard cell, cultured cell, leaf; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyruvate/Phosphoenolpyruvate kinase, catalytic core (InterPro:IPR015813), Pyruvate kinase, alpha/beta (InterPro:IPR015794), Pyruvate kinase, beta-barrel-like (InterPro:IPR011037), Pyruvate kinase (InterPro:IPR001697), Pyruvate kinase, C-terminal-like (InterPro:IPR015795), Pyruvate kinase, barrel (InterPro:IPR015793); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pyruvate kinase family protein (TAIR:AT2G36580.1); Has 9560 Blast hits to 9533 proteins in 2700 species: Archae - 164; Bacteria - 5966; Metazoa - 522; Fungi - 215; Plants - 538; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2155 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:19649336..19652237 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51892.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 474 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSVARFDFSW GDADYHQETL DNLKVAVRST KKLCAVMLDT VGPELQVINK SEKAITLKAD GLVTLTPNQD QEASSEVLPI NFNGLAKAVK KGDTIFVGQY 101: LFTGSETTSV WLEVDEVKGD DVICLSRNAA TLAGSLFTLH SSQVHIDLPT LTEKDKEVIS TWGVQNKIDF LSLSYCRHAE DVRQTREMLK KLGDLSQTQI 201: FAKIENVEGL THFDEILQEA DGIILSRGNL GIDLPPEKVF LFQKAALYKC NMAGKPAVLT RVVDSMTDNL RPTRAEATDV ANAVLDGSDA ILLGAETLRG 301: LYPVETISTV GRICAEAEKV FNQDLYFKKT VKYVGEPMTH LESIASSAVR AAIKVKASVI ICFTSSGRAA RLIAKYRPTM PVISVVIPRV KTNQLKWSFS 401: GAFEARQSLI VRGLFPMLAD PRHPAESTSA TNESVLKVAL DHGKHAGVIK SHDRVVVCQK VGDASVVKII ELED |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)