AT3G52810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : purple acid phosphatase 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
purple acid phosphatase 21 (PAP21); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine phosphatase activity, acid phosphatase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: petal, leaf whorl, fruit, sepal, flower; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Metallophosphoesterase (InterPro:IPR004843), Purple acid phosphatase-like, N-terminal (InterPro:IPR008963); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: purple acid phosphatase 22 (TAIR:AT3G52820.1); Has 2230 Blast hits to 2213 proteins in 478 species: Archae - 3; Bacteria - 838; Metazoa - 257; Fungi - 79; Plants - 752; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 301 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:19571089..19573640 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50643.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 437 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKKMKIFGFL ISFSLFFLSP FVCQANYDSN FTRPPPRPLF IVSHGRPKFY PQQVHISLAG KDHMRVTYTT DDLNVASMVE YGKHPKKYDK KTAGESTSYT 101: YFFYNSGKIH HVKIGPLKPN TKYYYRCGGH GDEFSFKTPP SKFPIEFAVA GDLGQTDWTV RTLDQIRKRD FDVFLLPGDL SYADTHQPLW DSFGRLLETL 201: ASTRPWMVTE GNHEIESFPT NDHISFKSYN ARWLMPHAES LSHSNLYYSF DVAGVHTVML GSYTPYESHS DQYHWLQADL RKVDRKKTPW LVVVMHTPWY 301: STNKAHYGEG EKMRSALESL LYRAQVDVVF AGHVHTYERF KPIYNKKADP CGPMYITIGD GGNREGLALR FKKPQSPLSE FRESSFGHGR LRIIDHKRAH 401: WSWHRNNDEM SSIADEVSFE SPRTSSHCHS NRYRGEI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)