AT3G52340.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.993 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
sucrose-phosphatase (SPP2) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase 2 (SPP2); FUNCTIONS IN: phosphatase activity, magnesium ion binding, catalytic activity, sucrose-phosphatase activity; INVOLVED IN: sucrose biosynthetic process, metabolic process; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sucrose-phosphate synthase (InterPro:IPR006380), Sucrose-6-phosphate phosphohydrolase C-terminal (InterPro:IPR013679), HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB (InterPro:IPR006379), Sucrose-phosphate phosphatase (InterPro:IPR006378), Sucrose phosphatase, plant/cyanobacteria (InterPro:IPR012847); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase family protein (TAIR:AT2G35840.3); Has 881 Blast hits to 877 proteins in 325 species: Archae - 7; Bacteria - 649; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 174; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 51 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:19407412..19409182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48681.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 423 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MERLISHPPL MIVSDLDHTM VDHQDHENLS LLRFNSLWEY AYRRDSLLVF STARSPVLYK ELRKEKPLLT PDIIITSIGT EIAFGNSMVP DHAWVESLNS 101: CKWNREIVLE ETSKFPELTL QPKTEQRLHK VSFYIDEGKG EALTKELSQL LEKRGLDVKI IYSWGKNVDV IPRGAGKGEA LEYLLKKLQA EGIFPVNTLA 201: CGDSEHDAEL FSIPDVHGVM VSNSQEELLK WRSENALNNL KVIHSTERCA DGIIQAIGHF NLGPDLSPRD VSEFLDRKMD NVNPGHEVVR FYLFYERLRR 301: GEIKNYETYI ASFKDSCLHA AVLFHPSGAE KSLRDTIDEL KKCYGDKRGK KFWVWVDQVL VTDTIPGKWI VKFDKWEQCE DESQCCKTTV EFTSKGGDLV 401: WEKVKQIWSE ESKVKDDNSS WIL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)