AT3G51895.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 0.586 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sulfate transporter 3;1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a sulfate transporter. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sulfate transporter 3;1 (SULTR3;1); FUNCTIONS IN: secondary active sulfate transmembrane transporter activity, transporter activity, sulfate transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: sulfate transport, transport, transmembrane transport; LOCATED IN: integral to membrane, membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sulphate transporter (InterPro:IPR011547), Sulphate transporter/antisigma-factor antagonist STAS (InterPro:IPR002645), Sulphate anion transporter, conserved site (InterPro:IPR018045), Sulphate anion transporter (InterPro:IPR001902); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sulfate transporter 3;2 (TAIR:AT4G02700.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:19251503..19255677 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 72752.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 658 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGTEDYTFPQ GAEELHRRHH TVEAPQPQPF LKSLQYSVKE TLFPDDPFRQ FKNQNASRKF VLGLKYFLPI FEWAPRYNLK FFKSDLIAGI TIASLAIPQG 101: ISYAKLANLP PILGLYSSFV PPLVYAVLGS SRDLAVGTVA VASLLTGAML SKEVDAEKDP KLYLHLAFTA TFFAGVLEAS LGIFRLGFIV DFLSHATIVG 201: FMGGAATVVS LQQLKGIFGL KHFTDSTDVI SVMRSVFSQT HEWRWESGVL GCGFLFFLLS TRYFSIKKPK FFWVAAMAPL TSVILGSLLV YFTHAERHGV 301: QVIGDLKKGL NPLSGSDLIF TSPYMSTAVK TGLITGIIAL AEGVAVGRSF AMFKNYNIDG NKEMIAFGMM NIVGSFTSCY LTTGPFSRSA VNYNAGCKTA 401: MSNIVMAIAV MFTLLFLTPL FHYTPLVVLS AIIISAMLGL IDYQAAIHLW KVDKFDFLVC MSAYVGVVFG SVEIGLVVAV AISIARLLLF VSRPKTAVKG 501: NIPNSMIYRN TEQYPSSRTV PGILILEIDA PIYFANASYL RERIIRWIDE EEERVKQSGE SSLQYIILDM SAVGNIDTSG ISMMVEIKKV IDRRALKLVL 601: SNPKGEVVKK LTRSKFIGDH LGKEWMFLTV GEAVEACSYM LHTFKTEPAS KNEPWNNV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)