AT3G51240.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.934 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : flavanone 3-hydroxylase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes flavanone 3-hydroxylase that is coordinately expressed with chalcone synthase and chalcone isomerases. Regulates flavonoid biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
flavanone 3-hydroxylase (F3H); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase (InterPro:IPR005123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein (TAIR:AT4G10490.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:19025661..19026658 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 31088.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 274 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTRLARDFFA LPPEDKLRFD MSGGKKGGFI VSSHLQGEAV QDWREIVTYF SYPVRNRDYS RWPDKPEGWV KVTEEYSERL MSLACKLLEV LSEAMGLEKE 101: SLTNACVDMD QKIVVNYYPK CPQPDLTLGL KRHTDPGTIT LLLQDQVGGL QATRDNGKTW ITVQPVEGAF VVNLGDHGHF LSNGRFKNAD HQAVVNSNSS 201: RLSIATFQNP APDATVYPLK VREGEKAILE EPITFAEMYK RKMGRDLELA RLKKLAKEER DHKEVDKPVD QIFA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)