AT3G50980.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : dehydrin xero 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
dehydrin xero 1 (XERO1); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: response to water, response to stress; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: shoot apex, inflorescence meristem, petal, leaf whorl, seed; EXPRESSED DURING: F mature embryo stage, petal differentiation and expansion stage, E expanded cotyledon stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dehydrin (InterPro:IPR000167); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Dehydrin family protein (TAIR:AT5G66400.1); Has 1530 Blast hits to 1085 proteins in 133 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 1; Fungi - 0; Plants - 1529; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:18942034..18942721 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 13435.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -1.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 128 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESYQNQSGA QQTHQQLDQF GNPFPATTGA YGTAGGAPAV AEGGGLSGML HRSGSSSSSS SEDDGLGGRR RKKKGITEKI KEKLPGHHDS NKTSSLGSTT 101: TAYDTGTVHH EKKGMMEKIK EKLPGGHH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)