AT3G50460.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.676 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : homolog of RPW8 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Homolog of RPW8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
homolog of RPW8 2 (HR2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Powdery mildew resistance protein, RPW8 domain (InterPro:IPR008808); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: homolog of RPW8 3 (TAIR:AT3G50470.1); Has 107 Blast hits to 107 proteins in 13 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 2; Plants - 104; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:18727840..18728649 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23442.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 205 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPLTEIIAGA ALGLALQILH EAIQRAKDRS LTTSCILDRL DSTILRITPL MAKVEKLNKE SDESLRKVFE DLKHLLEKAV VLVEAYAELK RRNLLGKYRY 101: KRRIKELEGS LKWMVDVDVK VNQWADIKDL MAKMSEMNTK LEKIMGQPID CIISEDNTNM DIVERVDPSL EAKAGCSNSD SKPKIDIHLR WSKQSKDHGI 201: RFVLN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)